用模板批量生成的活码，后续可以设置为两种不同的模板吗(更改两种不同的表头）？

不能的，同一个批量模板生成的活码，里面的结构和样式都是一样的，你要是以后可能不一样，那不如现在就用两个模板来做，不然后面要改的话很麻烦，二维码还得重新打印